Разработчик-диабетик собрал искусственную поджелудочную железу, работающую на JavaScript​ Статьи редакции

Лиаму Зебеди понадобились инсулиновая помпа, пара контроллеров и несколько программ с открытым исходным кодом.

Здоровая поджелудочная железа вырабатывает инсулин и знает, когда и сколько его нужно — в ответ на изменение уровня глюкозы в организме. У больных диабетом поджелудочная железа работает с нарушениями.

  • Диабетики принимают инсулин для усвоения углеводов, по наитию определяя дозировки. В разной пище — разное количество углеводов со своим гликемическим индексом (скоростью усвоения). Законы разрешают производителям закладывать в информацию о пищевой ценности отклонения до 10% от того или иного значения.
  • Плохой сон нарушает метаболизм, при пробуждении инсулина требуется больше — как и при стрессе или болезни.
  • Организм менее восприимчив к инсулину, когда уровень сахара в крови больше положенного.

Диабетики, контролируя приём инсулина, занимаются математической оптимизацией, считает Зебеди. Его искусственная поджелудочная железа занимается тем же самым, только процесс на 80% автоматизирован.

Оборудование

  • Глюкометр FreeStyle Libre CGM.
  • Трансмиттер Miaomiao — передаёт данные с Libre (работает на NFC) на телефон по Bluetooth.
  • Nightscout — программа с открытым исходным кодом для хранения и визуализации данных для диабетиков первого типа (инсулин практически не вырабатывается организмом). Хостинг — Heroku.
  • Приложение xDrip, которое принимает данные по Bluetooth и отправляет их в Nightscout.
  • Инсулиновая помпа Medtronic — для инъекций инсулина.
  • Intel Edison + Explorer HAT — плата с поддержкой Wi-Fi и радиокоманд частотой 900 МГц.
  • Аккумулятор на 4400 мА.
  • OpenAPS — «операционная система» искусственной поджелудочной. Выгружает данные из Nightscout, прогнозирует и подстраивает доставку инсулина помпой, подгружает данные в Nightscout для непрерывного отслеживания. Исходный код открыт.

Цены

  • Помпа у разработчика уже была, стоит она, как правило, около €3100.
  • FreeStyle Libre CGM — €70 за считыватель (разовая трата) и €140 в месяц на сенсоры.
  • Трансмиттер Miaomiao — €200.
  • Хостинг Heroku для Nightscout — бесплатно.
  • xDrip — Зебеди пришлось купить годовую лицензию разработчика за €93, чтобы установить программу на телефон: Apple запрещает его загрузку в App Store.
  • Intel Edison обошёлся в €57. Мини-компьютер не продаётся уже два года, поэтому пришлось как следует поискать на Amazon и eBay.
  • Explorer HAT — плату изготовила компания Enhanced Radio в США за €68.
  • Аккумулятор Adafruit за €50 ёмкостью в два раза больше нужной — просто на всякий случай.
  • OpenAPS — бесплатно, открытый исходный код.

Итого, исключая помпу: €608.

Ежемесячные траты, исключая инсулин: €140.

Сборка

На сборку Зебеди потратил около девяти часов:

  • Час на чтение документации по OpenAPS, она очень большая.
  • Два часа на загрузку Jubilinux и настройку Edison.
  • Два с половиной часа на загрузку пакетов и библиотек с помощью APT и NPM. Поскольку OpenAPS — обычный набор простейших Bash-скриптов, всё пришлось загружать заново.
  • Час на покупку лицензии разработчика Apple и установку xDrip.
  • Час на настройку хостинга для Nightscout, с аутентификацией и особыми плагинами для OpenAPS.
  • Два часа на устранение багов. Система почему-то не считывала показатели из Nightscout. Не сумев устранить неполадки, Зебеди обратился за помощью в Gitter. Оказалось, проблема была в приложении Tomato, которым он пользовался для отслеживания уровня сахара в крови. Поэтому разработчик переключился на xDrip.
​Все нужные детали
​Трансмиттер Miaomiao
​Инсулиновые помпы (Зебеди использовал нижнюю)
​Модуль Intel Edison
​Подключение к модулю Edison через USB Serial. Зебеди использовал путь /dev/tty.usbserial-xyz 115200
​Установка Jubilinux
​Настройка протоколов SSH
​Лог OpenAPS

OpenAPS предельно проста благодаря большому собранию Bash, Python и JavaScript. В этот момент Зебеди столкнулся со стектрейсом ниже (список строк кода, которые были вызваны до возникновения в приложении сбоя).

myopenaps/monitor/glucose.json: Unexpected end of JSON input

Разработчик установил xDrip на замену Tomato. Первая — с открытым исходным кодом, что, замечает Зебеди, видно по простому дизайну.

​Интерфейс xDrip

Зебеди написал в Gitter, и через час ему помогли решить проблему: не хватало параметра dateString.

​Сообщение Зебеди

После код заработал.

Использование

Ниже — интерфейс Nightgraph. Зебеди пометил цифрами четыре основных элемента:

  1. Статус системы.
  2. Динамика уровня сахара в крови.
  3. Прогноз OpenAPS.
  4. Введение инсулина помпой.

OpenAPS каждые пять минут корректирует базальные профили, или дозировки подачи инсулина («Как OpenAPS принимает решения»). Основные параметры, которые вычисляет система:

  • Разница между текущим уровнем сахара в крови и средним за последние пять минут.
  • Среднее изменение уровня сахара за 15 и 45 минут.
  • Количество инсулина в организме: это важно, поскольку он расходуется неинтуитивно, оставаясь в теле какое-то время, а не исчезая вместе с переработанной глюкозой.
  • Чувствительность к инсулину.
Средний уровень сахара в крови — производная от предыдущих средних показателей, а количество инсулина в организме представляет собой экспоненциальную кривую Документация OpenAPS

Кроме того, OpenAPS замечает, когда Зебеди заболевает. За сутки до первых симптомов уровень сахара в крови у него значительно повышается.

OpenAPS, отмечает разработчик, — не панацея. Ему по-прежнему нужно принимать инсулин перед едой, да и с алкоголем система тоже не поможет. Тем не менее с OpenAPS ему гораздо удобнее и спокойнее.

​Собранное устройство
​Слева — трансмиттер Miaomiao, справа — датчик глюкометра
​Инсулиновая помпа
0
51 комментарий
Написать комментарий...
Звенислав Николаевич

На языке в котором '5' - '2' = 3, а '5' + '2' = '52' я бы как-то забоялся поджелудочную гонять 😂

Ответить
Развернуть ветку
Алексей Заузин

Вы, возможно, не поверите, но подобное поведение довольно логично и предсказуемо, если представлять себе как устроен javascript. Если вам подобная логика не нравится - вы можете писать строго типизированный код на typescript, например, где операция '5' - '2' приведет к ошибке еще на стадии компиляции.

Ответить
Развернуть ветку
Гала Перидоловна

Или C, но это не сделает из JavaScript нормальный язык. 

Ответить
Развернуть ветку
Мсье Риддлер

а что значит нормальный или не нормальный? ts программистам платят больше, чем c# или java - вполне нормально

Ответить
Развернуть ветку
Гала Перидоловна

И при чем тут typescript? Это всего лишь dsl, который пытается исправить косяки js. Насчёт зарплат не согласен. Можете привести источник?

Ответить
Развернуть ветку
Мсье Риддлер

https://habr.com/ru/company/moikrug/blog/443810/

сеньер жс получает в среднем больше, не считая языков для мобилок.

понятно что это не язык в целом, но важно его уметь правильно применять и работать с ним, что равносильно изучению нового языка. Плюс в вакансиях указывается typescript разработчик, а не js.

Ответить
Развернуть ветку
Гала Перидоловна

Что? Там по ссылке медианная зарплата Java и c# выше JavaScript. Какие средние зарплаты синьоров? Там даже верхние границы не соответствуют вашему заявлению. 

Ответить
Развернуть ветку
Мсье Риддлер

Ниже была дана расшифровка. Вы, видимо, забыли надеть очки или имели нетерпение и не сумели дочитать до выводов

Ответить
Развернуть ветку
Гала Перидоловна

Те вы говорите о том, что зарплаты выше потому, что в статье на хабре одна мертвая площадка заявляет о том, что зарплаты ниже, но нужно не делать из этих данных выводы, а поискать зарплаты сеньоров, где был указан typescript? Прям вспоминаются те самые железные 146% уверенности в своих данных. 

Ответить
Развернуть ветку
Мсье Риддлер

а откуда данные что площадка мертвая? Из тех же 146%?

Ответить
Развернуть ветку
Гала Перидоловна

"Сейчас на сайте 979 вакансий и 130760 резюме, в среднем 10 откликов на вакансию"

Прям внизу написано.

Ответить
Развернуть ветку
48 комментариев
Раскрывать всегда