Мое небольшое исследование по поводу коронавируса 2019-nCoV

• Возможные пробелы в понимании
• Сходные признаки коронавирусов
• Приблизительная схема оценки больных
• Особенности защиты от вируса
• Возможное происхождение
• Итоги
• Последствия
• Влияние инкубационного периода:
  

Существует значительная вероятность что ученые еще не полностью понимают природу коронавируса 2019-nCoV или даже снова ошибаются, как это было с вирусом hCoV-EMC обнаруженный в 2012 году.

Тогда тоже было предположение что у hCoV-EMC и SARS одинаковый путь заражения.Но после исследований это не подтвердилось.В 2012 результате исследований Медицинского центра при Университете Бонна (University of Bonn Medical Center) при модифицировании почечных клеток хомяков, ученые заставили их вырабатывать человеческие рецепторы ACE2.

SARS -коронавирус смог проникнуть в эти клетки, однако hCoV-EMC это не удалось — это доказывает, что вирусу hCoV-EMC для проникновения в клетку не нужны рецепторы ACE2. Что самое интересное, тогда не удалось установить, какие рецепторы нужны hCoV-EMC.

Также сигналом, что ученые еще полностью не понимают происхождение вируса, может служить недавнее заявление, что текущий вирус передался от змей, что многие ученые считают маловероятным.

В журнале Nature вышел материал с комментариями ведущих вирусологов со всего мира, заявляющих, что змеи вряд ли могли быть источником нового коронавируса.Другая группа исследователей Института Уханя,считают,что наиболее вероятным носителем коронавируса 2019-nCoV, была летучая мышь.

При этом, скорее всего этот вирус являеться гибридом другого коронавируса. Онм считают что этот коронавирус очень похож на тот, что произошел в 2003(SARS).Позже Сингуан Ли и его коллеги из Уханьского университета биоинженерии на днях предположили по сиквенсам геномов 2019-nCoV и других коронавирусов, что возбудитель нынешней эпидемии возник в результате гибридизации вирусов летучих мышей и змей, а еще одна группа ученых пришла к другим выводам.

Исследователи выделили вирус из жидкости, полученной из бронхов больных, секвенировали РНК, найденную там. Эти действия были проведены еще на пяти пациентах.Фактов, которые позволяют считать 2019-nCoV вирусом змей, ученые не обнаружили.Несмотря на эти сообщения существует несколько важных признаков, скорее всего не учтенных, которые могли пролить свет на особенности вируса.

Сейчас, ученые в стране пытаться тестировать ранее изготовленные вакцины предназначенные для других коронавирусов на 2019-nCoV, о чем только-что заявил глава Центра по контролю и профилактике заболеваний Сюй Вэньбо.Еще один ученый пытается въехать в страну и протестировать образцы.Успех может изменить ситуацию. В ином случае ждать вакцины придется очень долго, до нескольких лет.

ченые подтвердили достоверность того, что коронавирус относится к той же группе вирусов, что и возбудитель атипичной пневмонии SARS-CoV, а также штамм ближневосточного респираторного синдрома MERS-CoV. От заболеваний, вызванных этими вирусами, погибли сотни человек.

Геном 2019-nCoV очень похож на уже известные коронавирусы.Его РНК больше всего (совпадение 96,2% нуклеотидов) походила на РНК вируса, сходного с вирусом атипичной пневмонии, обнаруженного пару лет назад у летучих мышей Rhinolophus affinis в провинции Юнань.

Также геном 2019-nCoV на 79,5% совпадает с РНК вируса атипичной пневмонии SARS-CoV.Он сохранил без изменений один из пяти его участков. Так же у него присутствует тот же рецептор (ACE2).

Однако, есть большая вероятность что новый вирус отличается от SARS и от вируса летучих мышей, в том числе летальностью,(о другом возможном отличии ниже)

В 2003(SARS), около 9% пациентов с подтвержденным диагнозом умерли Смертность была намного выше у пациентов старше 50 лет, достигая уровня смертности, приближающегося к 50% для этой подгруппы пациентов, в 2003 было отмечено 8437 случаев заболевания, из которых 813 закончились летальным исходом.

Сейчас же более от 1300(реальных вчера,2000 реальных сегодня,Reuters) до 1700(гипотетических вчера,3000 гипотетических сегодня,уже вчера,сегодня 2989,подтвердилось!) подтвержденных случаев заражения пневмонией, вызванной коронавирусом.Для сегодня(вчера) предположение таковое: 4000 - 5000 человек.На сегодня: 6000 -8000 человек.

Из них 237 человек находятся в тяжелом состоянии, свыше 40(56 сегодня) человек умерло (39 человек в провинции Хубэй, 1 - в провинции Хэбэй, 1 - в провинции Хэйлунцзян, 1 - в Шанхае)

Недавно в медицинском журнале Lancet появилась информация о заболевании целой семьи в том числе и ребенка. Это первый подобный случай. Ученые констатировали очень высокую заразность вируса, шанс заразиться при близком расположении заболевшего высокий.

Кроме того в Народной больнице Уханя зафиксировано отличные от других коронавирусов нерегулярные случаи признаков:У части пациентов на первых стадиях был слабый аппетит, усталость, психические проблемы, тошнота, рвота, диарея, головная боль. Только через время стали наблюдаться легочные симптомы пневмонии.

Ничего хорошего из изменяемых признаков точно нет, кроме того это может быть в части случае признаком мутабельности и нестабильности вируса.

Еще 25 карт-виджетов на которых можно проводить мониторинг распространения, но я не успеваю

https://www.maritimeherald.com/2020/01-25-viral-news-google-maps-shows-where-there-are-current-cases-of-coronavirus-trending-news-wuhans-coronavirus-china/

• Гонконг 5 случаев
• Макао 2 случая
• Тайвань 3 случая
• Таиланд 4 случая
• Япония 3 случая
• Южная Корея 2 случая
• США 6 случаев(3 ранее)
• Вьетнам 3 случая
  
• Сингапур 3 случая
• Непал 1 случай
• Франция 2 случая
• Австралия 5 случаев(1 ранее)
• Канада 1 случай(вчера)
• Камбоджа 1 случай(только что)
• Германия 1 случай(новое)
• Шри-ланка 1 случай(новое)

Заразившиеся в 2020 возрастом от 28 и 89.Самому молодому из умерших 48 лет, а самому старшему - 89, что в целом соответствует возрастным показателям по летальности для коронавирусов:

вероятность для тех, кто моложе 24 лет – ниже 1%. В возрасте 25-44 лет – до 6%, 44-64 года – до 15%, от 65 лет и старше – выше 55%. зафиксирована первая смерть в Пекине.Пострадавшим оказался 50-летний мужчина. 8 января он посетил Ухань и заболел пневмонией через семь дней после того, как вернулся в Пекин

Исследования 2014 года показали, что у беременных женщин, инфицированных MERS, были случаи мертворождения, так что возможны и подобные случаи и с 2019-nCoV.Недавно случился первый случай заражения ребенка.

До сорока пяти пациентов вылечились и были выписаны из больницы(49 сегодня,60 новые данные). Также зарегистрировано б случаев вчера(~2000 2684 4603, сегодня) с подозрением на новый тип коронавируса.Мой прогноз на завтра: от 6000 до 8000 тысяч.

К сожалению, не известно сколько реально погибших, но пока смертность ниже чем у SARS, причём власти поздно среагировали на коронавирус.

То есть возможно мутации негативно подействовали на смертность, но нельзя исключать фактор отложенного действия вируса, либо очень повезло/работа властей была эффективней по сравнению с 2003. Однако остается большая вероятность увеличения количества заболевших.

И, учитывая большой инкубационный период, большое количество стран с ситуациями заболевания и.т.д, количество заболевших может быть больше исходя из методов вероятностного распространения вируса, например, учитывая количество перевезенных за день пассажиров, например только один Международный аэропорт Ухань обслуживал 19 миллионов пассажиров, из которых 3400 ежедневно летели в другие страны.

Ставим максимальную вероятность для аэропорта в Ухани, ставим гораздо меньшую вероятность для аэропортов из других аэропортов и более медленных методов передвижения, при этом берем средневзвешенную вероятность для коронавирусов... для последних 5-7 дней до закрытия Аэропорта берем немного большую вероятность чем от начала распространения, пытаемся учитывать, сколько могло заболеть, учитывая возраст и вероятность подхватить болезнь, а также возможные последствия инкубационного периода и считаем.

Возможно у профессора Нила Фергюсона из Центре глобального анализа инфекционных заболеваний MRC при Имперском колледже Лондона, своя методология и она отличается, они насчитали не менее 1700 заболевших вчера. Новые данные о заболевших (2000 человек) коррелируют с предположениями. Таким образом возможно сегодня не менее 2500 -3000 заболевших гипотетически.

Кроме того, возможно еще одно допущение: если количество заболевших может быть больше, тогда возможно ли увеличение количества возможных погибших на основе этих мыслей о возможном количестве.

Например, если вирус передается через рецепторы легких (ACE2),надеюсь что наибольшая вероятность передачи вируса через дыхание, вирус не мутировал, не являться сходным hCoV-EMC,однако обычные марлевые повязки являются недостаточным способом защиты, особенно если становятся мокрыми, кроме того их необходимо регулярно менять,что обычно игнорируется (особенно в условиях нехватки илм высоких ценах на них,в прессе сообщаться В.т.ч. о сильном поднятии цен на СИЗ)

Поэтому лучше использовать противогазы, как средства зашиты, лишенных части недостатков марлевых повязок и легких респираторов.В любом случае не стоит рисковать и использовать перчатки и закрыть одеждой или очками любые участки кожи, при отсутствии спецодежды.Кроме того неосознанная привычка трогать лицо у многих тоже не способствует защите. Поэтому полностью закрытые противогазы,респираторы предпочтительнее.Само соотношение размера вируса и волокон повязок также не дает оптимизма.

К сожалению было допущено слишком много времени между решениями правительства, как это обычно бывает. Однако в других странах частично авторитарной модели возможно было бы хуже, всем стает известно только когда доходит до определенного этапа опасности.

После признания угрозы,уровень реагирования правительства после в целом на достаточно высоком уровне, однако, ожидаемо для людей все же были проколы,например те же видео лежащих мертвых людей разом с живыми.

Теперь можно предположить несколько вариантов:
Происхождение от летучих мышей и неизвестного животного как у коронавируса hCoV-EMC или летучих мышей и змей. В втором случае это уникальный случай, так как это передача от холоднокровных, даже хотя бы и частичная.

Возможно зараженные летучие мыши попали на рынок в Ухани,где торгуют ними в том числе для приготовления в виде супа,местного деликатеса.Подобные рынки, как рыбный рынок в Ухани (где продают разных видов животных) являются раем для распространения коронавируса, как текущий или тот что произошел в 2003(SARS). Так что повторения нового вируса было лишь вопросом времени.Часть вирусологов об этом регулярно напоминала.

Установлено, что точка входа вируса 2019-nCoV в организм человека или животного такая же, что и в случае с вирусом атипичной пневмонии SARS — рецепторы ACE2.К ним вирус пристыковывается своими присосками, а затем впрыскивает в клетку свою РНК.

Рецепторы находятся на клетках, расположенных в глубине легких, что есть причиной тяжелой пневмонии. У SARS обнаруженным в 2003 способ проникновения именно через ACE2, это делает новый коронавирус и SARS очень похожим.

В обычном случае типичный коронавирус, пришедший от летучих мышей, передается к другому виду животных или человеку, он перестает инфицировать клетки летучих мышей.

В случае с hCoV-EMC он продолжал это делать, как было доказано центром. Таким образом неплохо бы связаться с учеными и спросить их, делали ли они подобный эксперимент с новым коронавирусом.

Так можно окончательно убедиться о особенностях нового вируса.К сожалению я не знаю как это сделать, так что попытаюсь опубликовать это в разных местах, сначала на Хабре.

Если мое подозрение подтвердиться, то у нового коронавируса есть по крайней мере несколько вариантов переносчиков болезни:людей,свиней и некоторых видов летучих мышей.Это очень плохо, так как неизвестно учитывают эту проблему власти.

Кроме того высокая вероятность мутаций этого вируса может быть опасна и может привести к появлению "универсального" вируса.Рано или поздно подобные коронавирусы могут появиться, что может быть очень плачевно

К сожалению, из-за большого инкубационного периода и возможных мутаций еще возможны различные изменения, относительное малое количество погибших может водить в заблуждения.

Многие намекают на малую смертность по сравнению с обычным ОРВИ, однако опасным может сделать не только смертность, но и высокая возможность мутаций,большой инкубационный период, высокая заразность и возможное кроссвидовое заражение существ,возможность "бесшумного" распространения, а также другие факторы,что может изменить общую ситуацию.

С большой вероятностью новый вирус не настолько страшный по сравнению с SARS(из-за большей летальности) и особенно hCoV-EMC(из-за кроссвидового размножения вируса).

Последний я считаю самым опасным, из-за неустановленного типа рецепторов,через который вирус передается, что может быть предзнаменованием появления нового кроссвидового вируса,передающегося от животным к человеку, так и человека к животным без ограничений.

Смертность этого 019-nCoV не настолько высокая, и высокая вероятность умереть существует только у определенных возрастных групп.

Самая большая вероятность:нанесение существенных материальных трат для страны.Опасность:Финансовая.Вероятность очень большая.
Большая вероятность:Новый экономический кризис. Финансовые рынки уже реагируют.

В случае, если межвидовая передача вируса подтвердиться (что я хочу попросить проверить), последствия могут быть хуже.Опасность:Увеличиться.Вероятность средняя.

В случае, если вирус мутирует последствия мутирует последствия могут быть самыми разными до значительного увеличения последствий.В случае, если вирус распространиться на близкую индию ситуация может стать очень сложной. .Опасность:Высокая. Вероятность:Средняя,только более 30 тыс. индийских студентов в стране...

Самым страшным последствием может быть паника. В случае если власти не смогут контролировать ситуацию,или слишком напугают население.Опасность:Колоссальная.Вероятность:Очень низкая.

При такой вероятности если населения милиарной страны попытается прорвать границы и тогда будут благоприятные условия для распространения вируса.Огромный шанс заразить граждан индии что может создать самую опасную миграцию в мире, при чем часть населения будет больна.

Отмечу шанс индивидуального выживания для населения, попытавшегося сбежать падает еще ниже, чем оставаться в текущей ситуации.

Однако этот сценарий можно избежать, создав общемировую поддержку зараженных,например в соцсетях, в том числе и со стороны государств.В таком случае победить эту вспышку коронавируса вполне возможно.

К сожалению оказалось, что даже технически продвинутым и мощным странам тяжело в одиночку справляться с последствиями, поэтому хотелось чтобы другие страны и организации более активно помогли в этом и других случаях, чтобы снизить вероятность паники и самого худшего сценария.

К сожалению, средняя длительность болезни и ее тяжесть достаточно высокая. Так что все еще нескоро закончиться. Получается что фактор нового года даже может помочь:у населения на руках достаточно денег чтобы оплатить еду... в течении несколько месяцев, не выходя на работу.

По оценкам немецких экспертов из Геттингенского университета, еще не было пика в распространении 2019-nCoV, а настоящим испытанием для мира станет март. В таком случае количество заразившихся может превысить результат SARS(около 8тыс), впрочем я ожидаю гораздо меньшую смертность чем у SARS на 1000 заболевших, не более 40 человек на тысячу.

В случае достижения позитивного результата: успеха в испытаниях более ранних вакцин, все может ускориться в том случае если власти разрешат использовать их без дополнительного тестирования.

К сожалению у вируса большой инкубационный период.
Это значит что текущие показатели заболеваний и смертности отражают только количество заболеваний в начале. То есть мы сейчас наблюдаем только первую группу заболевших, что появилась вначале. Таким образом бессмысленно винить власти в невозможности остановить болезнь.Влияние текущих ограничений, сделанных правительством будет, например в уменьшении роста экспоненты роста вируса через несколько недель или в лучшем случае уменьшении роста зараженных!

Поэтому заявление эпидемиологов о том что результаты будут видны только через недели или месяцы правильно. Кроме того текущее количество зараженных первого этапа может говорить о возможно превышении показателей 2003 года.Я надеюсь что кривая увеличения распространения вируса до пика распространении инфекции будет o(n) или не более о(n log n).

У болезни был большой промежуток, где не было никаких ограничений. Сейчас мы наблюдаем ситуацию увеличения количества заболачиваемых за тот период.Влияние мер принятых правительством мы увидим позднее.

Тоже самое и с подготовкой и обычной реакцией на заболевание. В итоге опаздывание в любом случае окажется достаточным для распространения болезни.

Кроме того около пяти миллионов жителей покинули Ухань до закрытия города из-за эпидемии нового коронавируса передает South China Morning Post, что вполне возможно учитывая временной лаг.

Таким образом было невозможно остановить распространения вируса, действуя по обычному протоколу реагирования на вирус.Только реагирование по более строгим протоколам маловероятно из-за нежелания распространять панику, подставлять власть, обмануться если результат не подтвердиться и.т.д

В изображении ниже я представляю различия между протоколами реагирования и опасностью включая лаг из-за инкубационного периода.

Фактор нового года кроме увеличения поездок имеет и хорошую сторону:У многих людей достаточно денег, чтобы прожить в течении несколько месяцев.

Специалисты из США и Великобритании опубликовали предварительную оценку заразности китайского коронавируса 2019-nCoV: они прогнозируют, что к 7 февраля, через две недели, в мире будет 250 000 зараженных новым вирусом.

Похожие расчеты содержит и другая модель, представленная специалистами из Гонконга. Как передает SCMP, в Ухане уже 44 000 зараженных, а инфекция распространилась по всем большим городам материкового Китая. По этой модели число заболевших удваивается каждые 6,2 дня.

Моя модель гораздо скромнее: сейчас не менее (3500-5000,5000-8000) зараженных, в будущем заболеет от 8000 до 100 000 человек.

Как подчеркивается в препринте статьи на medrXiv, носители распространяют вирус без проявившихся симптомов, что было одним из моих предупреждения когда я начал писать эту статью несколько дней назад.Все зависит по какой прогрессии будет развиваться вирус до окончании периода.

Самый опасный показатель — фактор репродукции инфекции (𝑅0), обозначающий, скольких здоровых заражает один заболевший. Это число лежит в диапазоне от 3,6 до 4. И это значит, что надо сократить пути для передачи инфекции в 75% случаев, чтобы остановить рост эпидемии. Расчеты в модели проводились по данным на 21 января.

Эпидемиолог из Гарварда Эрик Фейгл-Дин подчеркивает в Twitter, что «никогда в жизни не видел цифры в 3,8» и ожидает «термоядерной пандемии». Он также приводит цитаты из другого исследования, где 𝑅0 оценивается в 2,8.

По оценке эпидемиологов из Университета Ланкастера, Центра исследований вирусов в Глазго и Университета Флориды в Гейнсвилле, в Ухане выявлено лишь 5% заболевших.

Для сравнения: у вируса атипичной пневмонии (SARS) в 2003 году 𝑅0 составлял 2,0-3,5. Однако этот вирус не передавался во время инкубационного периода, а симптомы были более выражены. Фактор репродукции после карантина снизился до 0,4.

Для Уханя — 11-миллионного города в Китае, который стал эпицентром эпидемии — команда во главе с Джонатаном Ридом рассчитала, что при сохранении нынешнего фактора репродукции там будет 191529 зараженных.

Закрытие городов не поможет остановить китайский коронавирус, хотя и задержит его распространение в некоторой мере, полагают эксперты, опрошенные изданием Businеss Insider. Я также указывал на это выше. Это повлияет только на будущую ситуацию и то не настолько хорошо.

Единственный плюс это малая смертность.Однако у системы охраны здоровья есть свои пределы.При значительном увеличении количества зараженных будет большое ухудшение качества лечения. И это подтверждается. Необходима международная помощь в этом вопросе.

По сообщениям прессы, сейчас в Ухане не хватает ни врачей, ни тестов на вирус. Пациенты проводят часы в очередях в ожидании приема, а экспресс-тесты проводят лишь тем, у кого наиболее явно проявляются симптомы: температура, кашель, затрудненное дыхание.

Сейчас известно, что в качестве временной меры для снижения симптомов коронавируса китайских пациентов лечат двумя препаратами от ВИЧ — комбинацией лопинавира и ритонавира, пишет Bloomberg. Никаких эффективных противовирусных препаратов против вируса сегодня не существует.

Три дня назад я писал эту статью я бы не писал многого из того, что я написал сейчас. Сейчас худшие опасения подтверждаться.

ВОЗ необходимо принять вирус мировой угрозой. Китай уже не справляется с ситуацией. Нужен флешмоб поддержки в социальных сетях. Нужна материальная поддержка от стран. Необходимо проверить вирус как же как и hCoV-EMC, межвидовой проверки передачи вируса, что может дать дополнительную информацию.

• http://mbio.asm.org/content/3/6/e00515-12.abstract ,Human Coronavirus EMC Does Not Require the SARS-Coronavirus Receptor and Maintains Broad Replicative Capability in Mammalian Cell Lines — - mBio, 11.12.2012, doi: 10.1128/mBio.00515-12
  
  
• https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A2%D1%8F%D0%B6%D1%91%D0%BB%D1%8B%D0%B9_%D0%BE%D1%81%D1%82%D1%80%D1%8B%D0%B9_%D1%80%D0%B5%D1%81%D0%BF%D0%B8%D1%80%D0%B0%D1%82%D0%BE%D1%80%D0%BD%D1%8B%D0%B9_%D1%81%D0%B8%D0%BD%D0%B4%D1%80%D0%BE%D0%BC
• https://ru.wikipedia.org/wiki/2019-nCoV ,2019-nCoV
• https://www.thelancet.com/pb-assets/Lancet/pdfs/S0140673620301549.pdf ,Исследование заразности
• https://twitter.com/DrEricDing/status/1220919589623803905 ,Мнение эпидемиолога
• https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.23.20018549v1.full.pdf ,www.medrxiv.org
• https://www.scmp.com/news/hong-kong/health-environment/article/3047813/china-coronavirus-hong-kong-medical-experts-call ,china-coronavirus-hong-kong-medical-experts-call