Заработает, но скорость будет ограничена 2000 МБ/с — у PCIe 2.0 пропускная способность ниже. Хотя в любом случае больше 2 тысяч SSD показывает только при последовательном чтении, так что смысл ставить есть — прирост производительности по сравнению с SATA будет.