Итого, Jira хороша для процессного управления когда задачу нужно провести по стадиям, но не нужно достигать конкретных целей ограниченных во времени.

Поэтому для управления проектами лучше использовать BIPULSE ( http://bipulse.ru) который может работать поверх джиры, обеспечивает уровень Проектного управления и показывает все нужные данные для этого. Тогда будут и волки сыты (менеджеры смогут управлять проектами) и овцы целы (инженеры будут продолжать использовать джиру для учета дефектов и задач)