Исторически сложилось, что JIRA - это стандартный разрабовский инструмент во многих больших компаниях ии сотрудники по умолчанию имеют к ней доступ. Инструмент несовершенный и неповоротливый с минималистичным интерфейсом. Но оказалось, что ее возможности позволяют эффективно наладить "неадминистративный"  документооборот в целом и сэкономить за счёт отсутствия необходимости покупать ещё какой-то инструмент для этих побочных целей. В самом атлассиане это тоже понимают, поэтому уже несколько лет продвигают под сути одну и ту же джиру в разных обертках (jira core, jira software, service desk etc.). JIRA - это такой трамвай, старомодный, прямолинейный, но с грохотом довезёт куда надо. + Не забывайте про джирину вики-сестричку confluence и учитывайте, что весь этот зоопарк плагинов с атлассиновского маркетплэйса тоже стоит денег и работает с переменным успехом.