1. Скрам и в какой то степени аджайл - это набор проектов длиною в спринт. А все про проекты уже описано и изучено. В случае с аджайлом просто не применяется ничего с лозунгом: "мы же гибкие". Хуибкие.
2. Проблемы в менеджерах. Не умеют управлять проектами в целом, не важно какими. Нужно ТЭО, бизнес анализ, rnd/НИОКР, эти вещи всегда будут в том или ином виде, а недоменеджеры просто перекладывают все это на разработчика: "программировай, дальше разберемся" разбираться надо до кодинга и не разработчику.

Мое мнение: можно итерациями, можно гибко, можно как угодно, но проект надо вести как проект. И у аджайла в этом ловушка - там не написано как поступать эффективно.