Вполне ожидаемо, что кому-то подобное может навредить, а кому-то напротив - пришлось по душе. Я бы с целью удовлетворить интересы всех пользователей сделал возможность создания чата как с возможностью удаления сообщений так и без - соответственно все участники чата будут знать, как обстоят дела. Ну а для уже существующих чатов пусть при открытии будет всплывающее окно с просьбой выставить эту настройку.