Сталкиваясь с пороками плавленых сыров при их производстве, производители стремятся выявить причины их появления и как можно скорее перейти к их устранению. Основная причина появления пороков связана с характеристиками сырьевых материалов и ошибками в выборе ингредиентов. Кроме того, частой причиной возникновения пороков является слишком низкий или высокий уровень pH.