Не могли бы Вы привести реальный пример, каким образом на практике сотрудники компании-разработчика  применяют метод оформления актов сдачи-приемки, о которых Вы сообщаете. Это ежедневная или ежемесячная сдача кода или как? И еще вопрос — если таких актов не делается, а это обычная практика разработчиков (а не теоретиков-юристов), то организция не имеет по Вашему мнению исключительного права на разработанный код? Или это все относится к неоперившимся стартапам, которым непременно нужно проконсультироваться у юристов?
 Пожалуйста  приведите новеллы ГК или "актуальной судебной практики" для иллюстрации Ваших мыслеизъявлений.