Георгий, добрый день! Почти по всем пунктам, с которыми у вас возникли трудности, есть информация в Помощи для партнёров. Это не менее важный источник, чем договор (это где вы галочку ставили).
По порядку:
• Необходимость распечатывать этикетки на термопринтере: https://clck.ru/QJ6nV (кстати, требование появилось ещё в апреле)
• Плата за курьера: https://clck.ru/QJ73h
• Стоимость доставки возврата от покупателя: https://clck.ru/QJ79M
• Выплаты у нас происходят два раза в месяц: https://clck.ru/QJ7GA
Если деньги вовремя не пришли — надо разбираться: подскажите, пожалуйста, название своего юрлица.

Доверительная приёмка нужна, чтобы ускорить отгрузку: курьеру и на крупных точках приёма (фулфилмент-фабриках и сортировочных центрах). Тоже писали об этом в рассылках и Новостях: https://clck.ru/P7Qib
По спорному отправлению и рулону, который "на руках у курьера" — посмотрим, в чём дело.

Наконец, по ЭДО. Продавцы, у которых его нет, до сих пор видят наши документы лишь в личном кабинете и не подписывают их. Из-за этого мы не можем вести полноценный документооборот и учёт. И чем больше продавцов становится, тем важнее это исправить — чтобы многие наши с вами вопросы решались без промедлений на основе подписанных документов.
Поэтому с 1 июля ЭДО стал обязательным для всех, кто продаёт со своего склада. Вы можете за 1-2 дня подключить сервисы, в которых работаем мы (СФЕРА Курьер и Контур.Диадок), чтобы обмениваться документами напрямую. Получать и подписывать документы в этих сервисах можно бесплатно. Тарифицируется только отправка документов — в работе с нами этого не понадобится.