Артем, здравствуйте!
Вы можете начать работу как ИП, не вижу в этом проблем. Принимать оплаты от клиентов, заключать договоры можно и от ИП. Если ИП является правообладателем т.е. ИП заключал договоры на разработку, выплачивал вознаграждение за дизайн и разработку исполнителям и авторам: программистам, дизайнерам - он получил права на этот продукт. В дальнейшем после регистрации ООО вы можете передать исключительные права на использование сервиса от ИП на ООО, и в рамках ООО уже дорабатывать сервис и продавать третьим лицам. Также права использования ПО можно сразу передать от ИП покупателю. Часто при этом покупатели просят подтвердить наличие таких прав у ИП (нужно предоставить договоры, акты, платежки). Все зависит от того как вы видите развитие вашего бизнеса: хотите продать сервис иностранному венчуру или российскому фонду, а может быть частному инвестору? Хотите ли закрепить за собой долю при продаже? Планируете ли привлекать в соучредители работников компании за вклад в развитие продукта? В целом, чтобы понимать насколько экономически выгодно работать на ИП или сразу открывать ООО нужно чуть больше вводных. Тогда можно посчитать налоговую стратегию и выбрать что для вас будет выгоднее.