Такое часто происходит, если выводить сразу. Рекомендую подождать когда на бирже клиринг пройдёт и еще чуть-чуть для надёжности. Важно понимать, что биржа и брокер - не банк, слишком много клиентоориентированности от них ждать не стоит. Тинькофф старается, но вековые традиции бирж и брокеров перекладывать любые риски ошибок в расчётах на трейдера сломать невозможно.

Излишне удержанный НДФЛ возвращается двумя механизмами - есть попытка через 3-5 дней после вывода через "Вывод 24/7" (фактически это овердрафт, ведь деньги от биржи за продажу акций банку ещё не поступили). Второй раз это происходит раз в год, после закрытия предыдущего года и формирования налогового отчёта. Мне в этом году что-то порядка 30тр вернули в этот момент.