В ОС Astra Linux 1.8 используются ядра (Linux Kernel) новейших 6-х версий. Вместо одной версии ядра пользователям будут доступны две ветки — на базе ядра Linux 6.1 (с долговременной поддержкой), доработанного с учетом результатов исследований Технологического центра ИСП РАН, которое будет обновляться на протяжении всего жизненного цикла ОС, а также на базе последней версии (latest) 6.6 (с кратковременной поддержкой). Версия ядра Linux 6.1 ориентирована на пользователей, для которых первоочередными являются вопросы стабильной работы и информационной безопасности, поскольку ИСП РАН под руководством ФСТЭК России совместно с целым консорциумом разработчиков ведет большую работу по поиску и устранению уязвимостей в коде, формируя набор безопасных ядер, на которых могут строить свои решения отечественные разработчики.