"Тем более, что бранных смыслов в название не вкладывали"
Ну канееешно, не вкладывали они. Может еще и наименования наборов вы без задней мысли придумывали?!

"Это значит, что популярное коммерческое название бренда «Ёбидоёби» никто не заставляет менять."
Ну вы же понимаете, что именно этого и хотят; и если после смены юридического имени вы не смените наименование бренда - то это просто будет дополнительный повод... ну не знаю, дело там какое завести, еще один суд инициировать или как там действуют, а юридическим именем - вы в данном случае уже не прикроетесь?

"это обозначение компании, которая не требует государственной регистрации"
С чего бы это оно не требует? Или вы не собираетесь регистрировать товарный знак? Можно мне свое Ёбудоёби открыть?

Тот случай, когда "креатив" перешел границы и вышел боком, конечно.