Мне так же программисты сразу рекомендовали создать карту сайта, чтобы перестроить структуру сайта, так как изначально там было много огрехов. Детально расписано о том как сделать эту карту сайтов здесь https://seranking.ru/blog/seo/kak-sozdat-kartu-sajjta-rukovodstvo-po-seo-kartografii/ . Я знаю уже как пошагово сделать карту сайта, где отображаются ссылки на все страницы сайта. Там уже гораздо быстрее и проще навести порядок. Если сайт будет хорошо структурирован ему будет гораздо легче попасть в топ поисковых систем.