Если вы арендуете VPS хостинг с Free-BSD, тогда аналогичной командой для обновления является freebsd-update. Но есть нюанс – система проверит наличие апдейта, но решение об установке принимать вам. После скачивания вы получите уведомление на электронную почту, а для установки обновления нужно воспользоваться пакетом freebsd-update install.
К слову о безопасности, я недавно тоже статью писал: https://vc.ru/life/390377-kak-vybrat-hosting-dlya-svoego-sayta
Но там про безопасность не технического, а больше финансового и юридического характера.