Значительно влияние на позиции оказывают поведенческие факторы — набор действий пользователя на сайте и в поисковой выдаче, которые учитываются при ранжировании сайтов в Яндексе и Google. К ним относятся CTR, показатель отказов, время на сайте, глубина просмотра и т. п. Ухудшение значений этих показателей может привести к падению позиций. Причем отрицательная динамика может быть как естественной (например, сайт стал неудобен для пользователя, сниппет страницы стал менее привлекательным и т. д.), так и искусственно сниженной (если внезапно выросло количество отказов, но визиты имеют сомнительные источники).
Проблемы с дублями в джумла - довольно старый бородатый миф из 2010-2012 годов. В джумла 3 включаете в настройках новый роутер и дублей нет. В Joomla 4 он используется по умолчанию. GET-параметрами можно на любой CMS наплодить дублей, которые могут попасть в индекс, особенно если включены всякие обходы по яндекс метрике.
Да это реальная проблема. Пишите мне. Помогу.