Все сделал как вы описали. Файл apk сформировал, на смартфоне все работает.
Но приложение не цепляет файл манифеста из pwa. А когда публикуешь его в google play, и устанавливаешь его от туда, то вообще приложение работает как как стандартная страница браузера с адресной строкой в верху. Опять таки думаю по тому что приложение само по себе не связанно никак с pwa и просто открывает сайт как есть. И иконки не тянуться тоже, приложение устанавливается с дефолтной иконкой андроида