Если ваши аннотации имеют низкую Ground Truth Accuracy, а от ошибки выборки вы уже избавились, то наиболее вероятным виновником являются инструкции по аннотированию. Низкие показатели означают, что аннотаторы не смогли понять задание, поэтому вам первым делом нужно пересмотреть инструкции и внести в них уточнения. После этого нужно напрямую обсудить это с аннотаторами и вместе проработать несколько примеров. Если у аннотаторов возникнут вопросы, то делайте инструкции более понятными, пока на все эти вопросы не будут даны ответы.