Из-за проблемных генов возникает около 80% заболеваний. Поэтому важнейшим аспектом молекулярной медицины является применение технологий генной терапии. По сути, это лечение, основанное на изменении, замене или блокировки дефектных клеток, что устраняет причину болезни, а не только ее симптомы. Изменения в генетическом коде не передаются наследственным путем, так как они затрагивают лишь соматические клетки человека. Модификация генома клеток зародышевой линии на данный момент запрещена во многих странах, так как передача измененных ДНК может привести к серьезным последствиям.