Смотря о каком маркетплейсе речь / какая механика нужна. Специализированные решения недавно представили

- Точка. 

https://tochka.com/marketplace

Позволяет даже на УСН распределять поступающие средства так, чтобы платить налог только с комиссии Маркетплейса, а не со всей суммы, в тч которую надо перечислить продавцу или исполнителю. Подходит как для B2B, так и B2C, как для товарных торговых площадок, так и для услуг

- Тинькофф

https://oplata.tinkoff.ru/solution/safe-deal/

На виси было промо их сервиса: Безопасная сделка от Тинькофф Оплаты: как автоматизировать и обезопасить расчеты для онлайн-площадок и маркетплейсов
https://vc.ru/services/154635-bezopasnaya-sdelka-ot-tinkoff-oplaty-kak-avtomatizirovat-i-obezopasit-raschety-dlya-onlayn-ploshchadok-i-marketpleysov

Если правильно помню, то у Я.Кассы (ныне Ю.Кассы) было какое-то решение тоже, но не уверен.