Usb может пропадать из-за электромагнитных помех. Например у меня такой эффект был в момент включения ртутной настольной лампы, видимо от стартера этой лампы.

Хотя может вру. Может от лампы прорадал ethernet, а usb тоже прорадал на другом компе, но я не выяснил от чего