Был в подобной ситуации. Только еще и оборудование переделывали полностью с нуля, т.к. во время выполнения контракта сменился руководитель МУП-а и все предварительные договоренности отправились в топку. В итоге задержали поставку на 43 дня. Лишились обеспечения в размере 20% процентов контракта и сверху неустойку по суду. Плюс комплект оборудования по индивидуальному заказу на площадке год стоял, пока комплектующим не распродали.  А все почему? Как позже объяснили- мы зашли не на "свой" аукцион. 
Но были и обратные ситуации, когда получали свои деньги через суд. Поэтому сейчас перед участием в закупочной процедуре ОЧЕНЬ внимательно изучаем заказчиков.