Если вы на УСН (доходы), то при продаже товара стоимостью 1000 рублей, если маркетплейсом из этой суммы было удержано агентское вознаграждение в размере 100 рублей, а вам как продавцу маркетплейсом перечислено 900 рублей разницы между суммой поступлений от покупателя за реализованный товар (1 000 рублей) и суммой удержанного маркетплейсом вознаграждения (100 рублей), то при определении налоговой базы по УСН налогоплательщик должен отражать в доходах сумму в размере 1 000 рублей. Учет любых расходов, в частности, в виде удержанного маркетплейсом агентского вознаграждения в размере 100 рублей, при применении УСН с объектом налогообложения доходы не предусмотрен.