Если самые релевантные документы с двух сайтов группы аффилиатов имеют близкие расчетные значения релевантности, то можно наблюдать своеобразную чехарду – сегодня документ с сайта А, скажем, в топ-10, а документ с сайта В, скажем, в топ-50, а завтра – наоборот – документ с сайта В – в топ-10, документ с сайта А – в топ-50. Послезавтра – опять ротация.
У службы поддержки Яндекс всегда очень хорошо получается лукавить и писать отписки. Менталитет такой, сами понимаете :)