Если необходимо организовать работу некоторых сайтов через VPN, а некоторых без VPN, то можете воспользоваться этой инструкцией.
А если есть свой vpn server? Есть инфа как делать?
Выпустите сертификат на своем сервере и загрузите его. В остальном без изменений.