Перед этим компания потребовала добавить в бесплатное приложение оплату функций, которые в нём не упоминаются.
приносим свои извинения за возможные неудобства
Автор, Эпл всё же приносит извинения не за "возможные неудобства", а за "any confusion", т.е. за путаницу. В данном контексте это всё-таки имеет значение, т.к. компания не признаёт, что была не права, а указывает, что было недопонимание.