Моделирование — это последовательность действий и условий, которые ведут от инициации до исполнения процесса. Это один из важнейших этапов проекта, так как от него зависит конечная реализация системы. Суть, переданная моделью бизнес-процесса из жизни, должна полностью совпадать с ожиданиями рядового пользователя в информационной системе. Далее происходит создание информационной системы, в нашем случае ЭДО, и последующее ее тестирование с заказчиком и пользователями.
Как 30+ лет назад говорил ведущий инженер в компании где я работал - если автоматизировать бардак, то в лучшем случае мы получим "автоматизированный бардак".
Поэтому да - при переходе на ЭДО организационные задачи это самое сложное - изучить БП, предложить новые рациональные БП и, самое сложное, внедрить новые БП да так, чтоб их приняли :-)