Пекмез может быть также использован в качестве природного лекарства для лечения различных заболеваний или укрепления иммунной системы, сердечно-сосудистой, пищеварительной, дыхательной систем, благодаря своим полезным свойствам и высокому содержанию антиоксидантов. Пекмез снижает холестерин в крови.