Для первичного получения сертификата квалифицированной электронной подписи руководитель компании должен обратиться в удостоверяющий центр ФНС либо к доверенным лицам ФНС, имеющим право его выдачи. К ним относятся: АО «Аналитический центр», ПАО «Сбербанк», ПАО «Банк ВТБ», ПАО «Промсвязьбанк», АО «ЕЭТП», АО «Электронная Москва», АО «Т-Банк». Для этого руководитель лично посещал УЦ ФНС или доверенное лицо УЦ ФНС и оформлял сертификат квалифицированной электронной подписи, имея при этом токен и СКЗИ КриптоПро CSP 5.