Одной из ключевых особенностей E46 был новый дизельный двигатель, который был внедрен в автомобиль в 1999 году. Это был 2.0-литровый четырехцилиндровый двигатель, который обеспечивал высокую экономичность и отличную динамику. Также были оснащены передовые технологии, такие как система навигации, система контроля давления в шинах и система помощи при парковке. E46 также стал первой моделью, на которой был внедрен система навигации от BMW и крейслеровская система аудиосистемы, что значительно повысило уровень комфорта и удобства вождения.