У пациентов наблюдается снижение защитных функций (экспрессии очень важных белков в плотных контактах) респираторного, кожного и дыхательного эпителия, что способствует проникновению аллергенов, поллютантов, вирусов и бактерий. Кроме того, у них увеличивается выраженность адгезионных молекул, к которым присоединяются вирусы, создавая благоприятную почву для их размножения. Вирусы могут усиливать эозинофильное и нейтрофильное воспаление, что приводит к продолжительному течению и частому возникновению вирусных инфекций. Помимо этого, у пациентов с аллергическими заболеваниями нарушается интерфероновый ответ организма на вирусную инфекцию, что, в свою очередь, увеличивает продолжительность и тяжесть болезни. Причем, чем выше IgЕ ответ, тем ниже экспрессия интерферонов 1-3 типа (альфа, бета, лямда). Это свойственно как для аллергического ринита, так и для бронхиальной астмы у детей и взрослых. Поэтому аллергики страдают от вирусных инфекций чаще и дольше, чем люди без аллергических заболеваний.