Среди основных проблем предприниматели выделили высокие расходы на приобретение и замену оборудования, необходимость привлекать IT-специалистов и сложность взаимодействия с программой маркировки. Также упоминалось, что марки «Честного знака» выгорают на свету, что создаёт сложности при реализации продукции. Анна Раевская, индивидуальный предприниматель из Норильска, рассказала, что погодные условия, плохое качество интернета и прочие технические нюансы не были учтены при запуске программы.