Главная разница в их функциональности и назначении. Фрезерно-сверлильные станки заточены на выполнение фрезеровки, но при этом выполняют разнообразные операции, такие как: сверление, зенкерование и развертывание, а сверлильно-фрезерные созданы с широким функционалом для сверления отверстий, но при этом они тоже могут выполнять фрезерные операции.