Говоря о недостатках сублимационных принтеров, стоит, в первую очередь, отметить дороговизну самого принтера, высокую стоимость печати, расходных материалов, необходимость в особой термической бумаге, дополнительных кассетах для носителей нестандартного размера (10x15 см). Кроме того, принтеры должны быть всегда подключены к сети. Длительная подготовка принтера к печати, низкая производительность печати, необходимость в регулярном проветривании в силу неприятного запаха испаряющихся чернил также являются существенными недостатками данных принтеров.