Профессиональное образование Владимир Мооро получил в Санкт-Петербурге, где обучался сначала в Николаевском инженерном училище, а затем в Николаевской инженерной академии (1875–1878 гг.). Подобная двухступенчатая образовательная система позволяла поддерживать высокий уровень профессиональной подготовки военных инженеров. Пройдя трехлетнюю подготовку в училище, юнкера направлялись на действительную военную службу в строевые войска на срок не менее двух лет, после чего они имели право на сдачу конкурсных экзаменов для поступления в академию. Воспитанники академии получали глубокое разностороннее образование, включавшее изучение военных, инженерных, строительных, архитектурных и художественных дисциплин, дававшее возможность выполнять различные работы и занимать должности как в военных, так и в гражданских структурах.