В большинстве случаев передозировка мелатонина у детей привела к минимальным побочным эффектам. В последние годы в отделения неотложной помощи США стали поступать дети, потребляющие мелатонин в форме жевательных мишек. Дети часто принимают большие дозы мелатонина случайно, так как родители оставляют препарат в зоне досягаемости ребенка. Резкий всплеск использования мелатонина младенцами и детьми привел к 530-кратному увеличению звонков в центры контроля за отравляющими веществами и 420-процентному росту обращений в отделения скорой помощи с 2009 по 2020 года. Исследование 2022 года в городе Мичиган выявило, что звонки в центр по контролю за отравляющими веществами от родителей детей, которые приняли мелатонин, содержали в себе информацию о таких симптомах, как проблемы с желудком, сердечно-сосудистой и центральной нервной системой. Данных о влиянии мелатонина на здоровье детей пока недостаточно, но эксперты здравоохранения напоминают, что мелатонин- это гормон, так что вполне возможно, что прием мелатонина может оказать влияние на гормональное развитие детей, включая пубертат, менструальный цикл и повышенную выработку гормона пролактин.