Joomla точно так же нужно уметь готовить, как и все остальное. Joomla это фрейм со стандартами PSR. CMS  - почти тот же фрейм с предустановленным набором компонентов, которые показывают основные моменты работы с фреймом. Да, она не без греха была, но почти все, кто говорят про ректальную боль видели в работе джумлу лет 7-8 назад. Есть примеры новостников на ней с посещаемостью более 230к уников в сутки и магазинов с более чем 30 млн товаров. К тому же надо понимать, что сама джумла - это одна команда (+огромное сообщество), а виртумарт - другая команда, какой-нибудь шаблон-конструктор (а ля Хеликс) - 3я команда и качество кода у всех может быть  разное просто потому, что сторонний от джумлы разработчик не потрудился изучить  документацию и сделать канонично, а не через ж... Все почему-то думают, что можно поставить движок, нахватать варезных плагинов и модулей по 300 рублей за штуку, а потом джумла виновата, что сайт в дырах. 

Страшнее слова Joomla только словосочетание Joomla! Extensions Directory

Да ну, там отличный MVC подход для разработки. Разные философии работы — это не повод обсерать одно и завышать другое. Работал под Joomla и под WordPress, и под BitRix — разные философии, какие-то лучше подходят для одних задач, какие-то для других, но и многое зависит от команды.