Они излишне уплаченные налоги вернуть или перекинуть куда-нибудь не могут, а тут какую то систему создают.

Косяки некоторых инспекторов не говорит о неадекватности системы в целом. А уж о косяках разных более чем знаком. Всё просто, в срок не вернули = пишем жалобу в вышестоящий НО и заодно проценты даже если там пару рублей будет. Очень часто служебные проверки заводят даже за минимально выплаченные проценты из-за несвоевременного возврата.