После перехода Google на mobile-first... Всем все равно, никто ничего не понял. Видишь mobile-first index? Нет. Я тоже. А он есть.
В Яндексе не дураки сидят и давно знают что такое AMP. Вряд ли робот Яндекса ходит на amphtml. А если и ходит, то по общим правилам отрабатывает rel="canonical".
Заходит. В выдаче две страницы в итоге с хвостом AMP и каноническая.