Всё началось очень просто. Я собрал продуктовый заказ в Яндекс маркете, в который встроили яндекс еду, и в корзине списал бонусами почти всю сумму, к оплате осталось 8 рублей. Только на этапе оплаты отразилась сумма без списания бонусов, близкая к полной стоимости заказа, но не один в один как без применения бонусов.