Я думаю в этом вопросе стоит учесть то, какой бэкенд вы хотите писать. Если речь, например, о бэке для приложений и сайтов - думаю достаточно Java. Во всяком случае вы сможете быстрой войти в профессию. А потом уже изнутри посмотрите на C#, и, если останется стимул - освоите и его. В любом случае - почитайте преимущества и недостатки обоих языков относительно друг друга, думаю это поможет вам с выбором. Успехов!