Это при всех нареканиях к налоговой, самая простая и отлаженная система.

Каждый году, в декабре вы должны понимать одно из двух:
- подайте на возврат ндс?
- подаёте на возмещение ндс?

Если конечно у вас положительный баланс с налоговой. А не вы ей должны ндс.

После этого поедете годовые отчёты до апреля и в июле получайте возврат, если вы возвращайте. ( конечно если налоговая согласна)

Если же вы подали на возмещение то возмещайте в след квартале и дальше.