Можно было через чат-боты на прямую в шлюз компании чат-бота, но через встроенную систему телеграмма нет

Да, но законы либертарианства* не действуют к огромному сожалению, хочешь прикрутить в какого-то бота - нужно делать по правилам тех же я.денег и ко.
Не раз сталкивался с отклонением чат-бота со стороны лик-пей по причине "не соответствует внутренным правилам компании", вот все и забивали болт на это дело, да и магазинов не так много в тг встречал, в основном все едут с тг на сайт)

В построенных в телеге платежных системах - да. В самом мессенджере - нет.