Самозанятый может платить взносы в ПФР на добровольной основе, есть такая опция.
Можно работать и просто с физиком. Но тогда организация должна сама рассчитать и заплатить за него налоги и взносы, как за сотрудника. Это, во-первых, неудобно, во-вторых, по расходам равнозначно трудовому договору, в-третьих, есть риск признания отношений трудовыми, т.к. деньги поступают от компании физику на регулярной основе. А если есть статус самозанятого, то у вас не работают, вам оказывают услугу - вполне официально :)
Это происходит потому, что в России не принято обращаться к юристу до заключения договора. Я в юридическом сервисе пару лет назад запускала акцию для франчайзи: проверим ваш договор с франчайзером за 4500 рублей. На тот момент это самая дешевая услуга у нас была, но клиенты все равно говорили «дорого». К тому же мы выяснили, что многие отдают за франшизу последние 50к или берут под это кредит. В договоре там, естественно, сплошные консультационные услуги.
Для таких дешёвых «франшиз» с неграмотными франчайзерами иногда работает лайфхак: этот договор не может заключить физическое лицо, только компания или ИП. На практике мошенники заключают со всеми подряд. В такой ситуации можно деньги вернуть, если конечно к этому моменту организация ещё существует...
У вас, кстати, ещё не самая плохая ситуация, где франчайзер участвовал в процессе. Иногда вам просто передаются материалы с сомнительным товарным знаком, ну и на этом все.