В 1С:Бухгалтерия нет возможности вести штатное расписание и воинский учет, учитывать индивидуальные графики работы, сверхурочную работу и работу в праздники / выходные, а также нет сложных формул для расчета зарплаты. Многие операции производятся вручную: расчет ежегодного отпуска, командировки, расчет компенсации отпуска при увольнении и др.