Проблема Яндекс.Навигатора что его разрабатывает команда хипстеров не покидающая пределы МКАД. В пределах МКАД навигатор неплох, но стоит покататься за его пределами как понимаешь что у него куча недостатков. Причем это не что-то такое фатальное, а мелочи которые можно достаточно легко исправить добавив пару настроек. Но разрабам некогда, у них изолента не наклеена.