Столкнулся с похожей проблемой, при синхронизации папок с уже имеющимися на диске, создается такая же папка с пометкой (2). НО! я не знаю каким образом мне удалось синхранизировать одну папку, у нее не появилась пометка (2) и все файлы чудом слились на пк и облаке.