Есть ощущение, что автотаргетинг игнорирует эту опцию, если выбран вариант "По фразе, наиболее близкой к запросу"
Видимо, потому что он может автоматически добавить одинаковые фразы в несколько групп объявлений. И тогда что?) Будет рандом?)
Походу все таки лучше делать старую добрую кросс-минусовку и выбирать опцию "С лучшим сочетанием показателей", так хоть будет показываться более кликабельное объявление по автотаргетингу.
Либо добавлять кросс-минусовку на уровне группы. Походу все равно от кросс-минусовки рекламщики никуда не денутся))