Если читать договор с банком (условия закрытия) и выполнять минимальные требования, проблем не будет.
Проверьте куда и кому платили, если физикам просто по выдуманным поводам, снимаете деньги, работаете с однодневками вот причина. Просто так не закрывают счет. Если у Вас есть бухгалтер, прислушайтесь к нему.

Закон 115-ФЗ обязывает банки следить за операциями клиентов. Внутренняя служба финмониторинга банка следит за операциями и выявляет фирмы, которые ведут фиктивную деятельность и занимаются обналичкой.

1 Не проводите транзитные операции, не свойственные бизнесу и не ведущие к поставкам и предоставлению услуг.

2 Покажите банку, что ведёте реальную деятельность: оплачиваете аренду и жилищно-коммунальные услуги, перечисляете зарплаты сотрудникам. Узнайте, какие документы помогут это подтвердить.

3 Не снимайте наличные «на прочие цели» часто, используйте преимущественно безналичные расчёты.

4 Перечисляйте налоги напрямую с расчётного счёта.

5 Не переводите деньги в другие банки без видимых оснований на невыгодных условиях.

6 Заполняйте назначения платежей подробно и без ошибок.

7 Актуализируйте выбранные коды ОКВЭД. Все платежи должны им соответствовать.

8 Проверяйте достоверность сведений в единых реестрах (ЕГРЮЛ или ЕГРИП).

9 Проверяйте контрагентов на сайте налоговой, в сервисах Сбербанка, «Мое дело-бюро», «Спарк», «Контур-фокус».

10 Храните первичные документы, которые подтверждают законность операций: договоры, соглашения, спецификации, накладные и т.д.

11 Получив запрос от банка, оперативно выходите на связь и предоставляйте запрашиваемые документы в срок.